Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp988F6VKC7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp988F6VKC7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp988F6VKC7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp988F6VKC7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp988F6VKC7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp988F6VKC7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp988F6VKC7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp988F6VKC7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp988F6VKC7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp988F6VKC7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp988F6VKC7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp988F6VKC7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp988F6VKC7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp988F6VKC7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp988F6VKC7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp988F6VKC7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp988F6VKC7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp988F6VKC7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp988F6VKC7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp988F6VKC7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp988F6VKC7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp988F6VKC7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp988F6VKC7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp988F6VKC7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp988F6VKC7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp988F6VKC7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp988F6VKC7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp988F6VKC7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp988F6VKC7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp988F6VKC7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp988F6VKC7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp988F6VKC7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp988F6VKC7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp988F6VKC7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp988F6VKC7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp988F6VKC7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp988F6VKC7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp988F6VKC7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp988F6VKC7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp988F6VKC7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp988F6VKC7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp988F6VKC7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp988F6VKC7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Zfp988F6VKC7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Zfp988F6VKC7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Zfp988F6VKC7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp988F6VKC7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp988F6VKC7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp988F6VKC7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp988F6VKC7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp988F6VKC7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp988F6VKC7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp988F6VKC7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp988F6VKC7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp988F6VKC7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp988F6VKC7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp988F6VKC7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp988F6VKC7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp988F6VKC7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp988F6VKC7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp988F6VKC7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp988F6VKC7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp988F6VKC7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp988F6VKC7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp988F6VKC7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp988F6VKC7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp988F6VKC7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp988F6VKC7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp988F6VKC7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp988F6VKC7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp988F6VKC7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp988F6VKC7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp988F6VKC7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp988F6VKC7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp988F6VKC7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp988F6VKC7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp988F6VKC7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp988F6VKC7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp988F6VKC7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp988F6VKC7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp988F6VKC7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp988F6VKC7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp988F6VKC7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp988F6VKC7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp988F6VKC7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp988F6VKC7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp988F6VKC7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp988F6VKC7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp988F6VKC7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp988F6VKC7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp988F6VKC7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp988F6VKC7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp988F6VKC7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp988F6VKC7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp988F6VKC7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp988F6VKC7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp988F6VKC7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp988F6VKC7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp988F6VKC7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms