Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm340F6RGI3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms