Protein–RNA interactions for Protein: F6RFI0

Gm9887, Predicted gene 9887, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9887F6RFI0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Gm9887F6RFI0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Gm9887F6RFI0 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm9887F6RFI0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
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