Protein–RNA interactions for Protein: E9QA15

Cald1, Caldesmon 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cald1E9QA15 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cald1E9QA15 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cald1E9QA15 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cald1E9QA15 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cald1E9QA15 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cald1E9QA15 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cald1E9QA15 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cald1E9QA15 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Cald1E9QA15 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Cald1E9QA15 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cald1E9QA15 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cald1E9QA15 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cald1E9QA15 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cald1E9QA15 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cald1E9QA15 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cald1E9QA15 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cald1E9QA15 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cald1E9QA15 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cald1E9QA15 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Cald1E9QA15 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cald1E9QA15 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cald1E9QA15 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cald1E9QA15 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cald1E9QA15 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cald1E9QA15 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cald1E9QA15 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cald1E9QA15 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cald1E9QA15 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cald1E9QA15 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cald1E9QA15 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cald1E9QA15 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cald1E9QA15 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cald1E9QA15 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Cald1E9QA15 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cald1E9QA15 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cald1E9QA15 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cald1E9QA15 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cald1E9QA15 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cald1E9QA15 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cald1E9QA15 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cald1E9QA15 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cald1E9QA15 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cald1E9QA15 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cald1E9QA15 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Cald1E9QA15 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cald1E9QA15 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cald1E9QA15 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cald1E9QA15 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cald1E9QA15 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Cald1E9QA15 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cald1E9QA15 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Cald1E9QA15 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cald1E9QA15 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cald1E9QA15 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cald1E9QA15 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cald1E9QA15 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cald1E9QA15 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cald1E9QA15 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cald1E9QA15 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cald1E9QA15 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cald1E9QA15 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cald1E9QA15 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cald1E9QA15 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Cald1E9QA15 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cald1E9QA15 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cald1E9QA15 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cald1E9QA15 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cald1E9QA15 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cald1E9QA15 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cald1E9QA15 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cald1E9QA15 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cald1E9QA15 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cald1E9QA15 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cald1E9QA15 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cald1E9QA15 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cald1E9QA15 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cald1E9QA15 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cald1E9QA15 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cald1E9QA15 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cald1E9QA15 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cald1E9QA15 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cald1E9QA15 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Cald1E9QA15 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cald1E9QA15 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cald1E9QA15 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cald1E9QA15 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cald1E9QA15 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cald1E9QA15 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cald1E9QA15 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cald1E9QA15 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cald1E9QA15 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cald1E9QA15 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cald1E9QA15 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cald1E9QA15 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cald1E9QA15 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cald1E9QA15 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cald1E9QA15 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cald1E9QA15 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cald1E9QA15 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cald1E9QA15 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms