Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc7bE9Q9Y3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc7bE9Q9Y3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms