Protein–RNA interactions for Protein: E9Q956

Mcmdc2, Minichromosome maintenance domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcmdc2E9Q956 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mcmdc2E9Q956 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mcmdc2E9Q956 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mcmdc2E9Q956 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mcmdc2E9Q956 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mcmdc2E9Q956 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mcmdc2E9Q956 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Mcmdc2E9Q956 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Mcmdc2E9Q956 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mcmdc2E9Q956 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mcmdc2E9Q956 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mcmdc2E9Q956 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mcmdc2E9Q956 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mcmdc2E9Q956 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mcmdc2E9Q956 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mcmdc2E9Q956 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mcmdc2E9Q956 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Mcmdc2E9Q956 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mcmdc2E9Q956 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mcmdc2E9Q956 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mcmdc2E9Q956 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mcmdc2E9Q956 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mcmdc2E9Q956 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mcmdc2E9Q956 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mcmdc2E9Q956 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Mcmdc2E9Q956 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Mcmdc2E9Q956 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mcmdc2E9Q956 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mcmdc2E9Q956 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mcmdc2E9Q956 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mcmdc2E9Q956 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mcmdc2E9Q956 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mcmdc2E9Q956 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mcmdc2E9Q956 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mcmdc2E9Q956 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mcmdc2E9Q956 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mcmdc2E9Q956 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mcmdc2E9Q956 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mcmdc2E9Q956 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mcmdc2E9Q956 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mcmdc2E9Q956 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mcmdc2E9Q956 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mcmdc2E9Q956 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Mcmdc2E9Q956 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mcmdc2E9Q956 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mcmdc2E9Q956 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mcmdc2E9Q956 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mcmdc2E9Q956 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mcmdc2E9Q956 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mcmdc2E9Q956 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mcmdc2E9Q956 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mcmdc2E9Q956 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mcmdc2E9Q956 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Mcmdc2E9Q956 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mcmdc2E9Q956 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mcmdc2E9Q956 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mcmdc2E9Q956 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mcmdc2E9Q956 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mcmdc2E9Q956 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mcmdc2E9Q956 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Mcmdc2E9Q956 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mcmdc2E9Q956 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mcmdc2E9Q956 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mcmdc2E9Q956 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mcmdc2E9Q956 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mcmdc2E9Q956 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mcmdc2E9Q956 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mcmdc2E9Q956 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mcmdc2E9Q956 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mcmdc2E9Q956 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Mcmdc2E9Q956 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mcmdc2E9Q956 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Mcmdc2E9Q956 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mcmdc2E9Q956 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mcmdc2E9Q956 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mcmdc2E9Q956 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mcmdc2E9Q956 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mcmdc2E9Q956 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mcmdc2E9Q956 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mcmdc2E9Q956 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mcmdc2E9Q956 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mcmdc2E9Q956 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Mcmdc2E9Q956 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mcmdc2E9Q956 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mcmdc2E9Q956 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mcmdc2E9Q956 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mcmdc2E9Q956 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mcmdc2E9Q956 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mcmdc2E9Q956 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mcmdc2E9Q956 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mcmdc2E9Q956 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mcmdc2E9Q956 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mcmdc2E9Q956 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mcmdc2E9Q956 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mcmdc2E9Q956 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mcmdc2E9Q956 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mcmdc2E9Q956 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mcmdc2E9Q956 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mcmdc2E9Q956 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mcmdc2E9Q956 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms