Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8Q6

Ccdc141, Coiled-coil domain-containing 141, mousemouse

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc141E9Q8Q6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc141E9Q8Q6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc141E9Q8Q6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc141E9Q8Q6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc141E9Q8Q6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc141E9Q8Q6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc141E9Q8Q6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc141E9Q8Q6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc141E9Q8Q6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc141E9Q8Q6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc141E9Q8Q6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc141E9Q8Q6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc141E9Q8Q6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc141E9Q8Q6 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc141E9Q8Q6 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc141E9Q8Q6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc141E9Q8Q6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc141E9Q8Q6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc141E9Q8Q6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc141E9Q8Q6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc141E9Q8Q6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc141E9Q8Q6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc141E9Q8Q6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc141E9Q8Q6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc141E9Q8Q6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc141E9Q8Q6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc141E9Q8Q6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc141E9Q8Q6 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc141E9Q8Q6 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc141E9Q8Q6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc141E9Q8Q6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc141E9Q8Q6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc141E9Q8Q6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc141E9Q8Q6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc141E9Q8Q6 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc141E9Q8Q6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc141E9Q8Q6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc141E9Q8Q6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ccdc141E9Q8Q6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ccdc141E9Q8Q6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc141E9Q8Q6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc141E9Q8Q6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc141E9Q8Q6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc141E9Q8Q6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc141E9Q8Q6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc141E9Q8Q6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc141E9Q8Q6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc141E9Q8Q6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc141E9Q8Q6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc141E9Q8Q6 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc141E9Q8Q6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc141E9Q8Q6 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc141E9Q8Q6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc141E9Q8Q6 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc141E9Q8Q6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc141E9Q8Q6 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc141E9Q8Q6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc141E9Q8Q6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc141E9Q8Q6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc141E9Q8Q6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc141E9Q8Q6 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc141E9Q8Q6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc141E9Q8Q6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc141E9Q8Q6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc141E9Q8Q6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc141E9Q8Q6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc141E9Q8Q6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc141E9Q8Q6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc141E9Q8Q6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc141E9Q8Q6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc141E9Q8Q6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc141E9Q8Q6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc141E9Q8Q6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc141E9Q8Q6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc141E9Q8Q6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc141E9Q8Q6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc141E9Q8Q6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc141E9Q8Q6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc141E9Q8Q6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc141E9Q8Q6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc141E9Q8Q6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc141E9Q8Q6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc141E9Q8Q6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc141E9Q8Q6 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc141E9Q8Q6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc141E9Q8Q6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc141E9Q8Q6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc141E9Q8Q6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc141E9Q8Q6 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc141E9Q8Q6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc141E9Q8Q6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc141E9Q8Q6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc141E9Q8Q6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc141E9Q8Q6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc141E9Q8Q6 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc141E9Q8Q6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc141E9Q8Q6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Ccdc141E9Q8Q6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc141E9Q8Q6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc141E9Q8Q6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms