Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6Y8

Usp31, Ubiquitin-specific peptidase 31, mousemouse

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Length 1,344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp31E9Q6Y8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp31E9Q6Y8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp31E9Q6Y8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp31E9Q6Y8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp31E9Q6Y8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp31E9Q6Y8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp31E9Q6Y8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp31E9Q6Y8 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp31E9Q6Y8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp31E9Q6Y8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp31E9Q6Y8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp31E9Q6Y8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp31E9Q6Y8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp31E9Q6Y8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp31E9Q6Y8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp31E9Q6Y8 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp31E9Q6Y8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp31E9Q6Y8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp31E9Q6Y8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp31E9Q6Y8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp31E9Q6Y8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp31E9Q6Y8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp31E9Q6Y8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp31E9Q6Y8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp31E9Q6Y8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp31E9Q6Y8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp31E9Q6Y8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp31E9Q6Y8 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp31E9Q6Y8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp31E9Q6Y8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp31E9Q6Y8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp31E9Q6Y8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp31E9Q6Y8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp31E9Q6Y8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp31E9Q6Y8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp31E9Q6Y8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp31E9Q6Y8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp31E9Q6Y8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp31E9Q6Y8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp31E9Q6Y8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp31E9Q6Y8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp31E9Q6Y8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp31E9Q6Y8 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp31E9Q6Y8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp31E9Q6Y8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp31E9Q6Y8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp31E9Q6Y8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp31E9Q6Y8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp31E9Q6Y8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp31E9Q6Y8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp31E9Q6Y8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp31E9Q6Y8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp31E9Q6Y8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp31E9Q6Y8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp31E9Q6Y8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp31E9Q6Y8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Usp31E9Q6Y8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Usp31E9Q6Y8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp31E9Q6Y8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp31E9Q6Y8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp31E9Q6Y8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp31E9Q6Y8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp31E9Q6Y8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp31E9Q6Y8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp31E9Q6Y8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp31E9Q6Y8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp31E9Q6Y8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp31E9Q6Y8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp31E9Q6Y8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp31E9Q6Y8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp31E9Q6Y8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp31E9Q6Y8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp31E9Q6Y8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp31E9Q6Y8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp31E9Q6Y8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp31E9Q6Y8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp31E9Q6Y8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp31E9Q6Y8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp31E9Q6Y8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp31E9Q6Y8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp31E9Q6Y8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp31E9Q6Y8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp31E9Q6Y8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp31E9Q6Y8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp31E9Q6Y8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp31E9Q6Y8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp31E9Q6Y8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp31E9Q6Y8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp31E9Q6Y8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp31E9Q6Y8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp31E9Q6Y8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp31E9Q6Y8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp31E9Q6Y8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp31E9Q6Y8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp31E9Q6Y8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp31E9Q6Y8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp31E9Q6Y8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp31E9Q6Y8 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp31E9Q6Y8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp31E9Q6Y8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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