Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E9

Simc1, SUMO-interacting motifs-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Simc1E9Q6E9 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Simc1E9Q6E9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Simc1E9Q6E9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Simc1E9Q6E9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Simc1E9Q6E9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Simc1E9Q6E9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Simc1E9Q6E9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Simc1E9Q6E9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Simc1E9Q6E9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Simc1E9Q6E9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Simc1E9Q6E9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Simc1E9Q6E9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Simc1E9Q6E9 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Simc1E9Q6E9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Simc1E9Q6E9 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Simc1E9Q6E9 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Simc1E9Q6E9 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Simc1E9Q6E9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Simc1E9Q6E9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Simc1E9Q6E9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Simc1E9Q6E9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Simc1E9Q6E9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Simc1E9Q6E9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Simc1E9Q6E9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Simc1E9Q6E9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Simc1E9Q6E9 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Simc1E9Q6E9 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Simc1E9Q6E9 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Simc1E9Q6E9 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Simc1E9Q6E9 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Simc1E9Q6E9 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Simc1E9Q6E9 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Simc1E9Q6E9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Simc1E9Q6E9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Simc1E9Q6E9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Simc1E9Q6E9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Simc1E9Q6E9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Simc1E9Q6E9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Simc1E9Q6E9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Simc1E9Q6E9 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Simc1E9Q6E9 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Simc1E9Q6E9 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Simc1E9Q6E9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Simc1E9Q6E9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Simc1E9Q6E9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Simc1E9Q6E9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Simc1E9Q6E9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Simc1E9Q6E9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Simc1E9Q6E9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Simc1E9Q6E9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Simc1E9Q6E9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Simc1E9Q6E9 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Simc1E9Q6E9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Simc1E9Q6E9 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Simc1E9Q6E9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Simc1E9Q6E9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Simc1E9Q6E9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Simc1E9Q6E9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Simc1E9Q6E9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Simc1E9Q6E9 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Simc1E9Q6E9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Simc1E9Q6E9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Simc1E9Q6E9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Simc1E9Q6E9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Simc1E9Q6E9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Simc1E9Q6E9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Simc1E9Q6E9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Simc1E9Q6E9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Simc1E9Q6E9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Simc1E9Q6E9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Simc1E9Q6E9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Simc1E9Q6E9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Simc1E9Q6E9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Simc1E9Q6E9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Simc1E9Q6E9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Simc1E9Q6E9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Simc1E9Q6E9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Simc1E9Q6E9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Simc1E9Q6E9 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Simc1E9Q6E9 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Simc1E9Q6E9 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Simc1E9Q6E9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Simc1E9Q6E9 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Simc1E9Q6E9 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Simc1E9Q6E9 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Simc1E9Q6E9 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Simc1E9Q6E9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Simc1E9Q6E9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Simc1E9Q6E9 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Simc1E9Q6E9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Simc1E9Q6E9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Simc1E9Q6E9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Simc1E9Q6E9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Simc1E9Q6E9 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Simc1E9Q6E9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Simc1E9Q6E9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Simc1E9Q6E9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Simc1E9Q6E9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Simc1E9Q6E9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Simc1E9Q6E9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms