Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc85cE9Q6B2 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc85cE9Q6B2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc85cE9Q6B2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc85cE9Q6B2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc85cE9Q6B2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc85cE9Q6B2 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc85cE9Q6B2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc85cE9Q6B2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc85cE9Q6B2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc85cE9Q6B2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc85cE9Q6B2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc85cE9Q6B2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc85cE9Q6B2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc85cE9Q6B2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc85cE9Q6B2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc85cE9Q6B2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc85cE9Q6B2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc85cE9Q6B2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc85cE9Q6B2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc85cE9Q6B2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc85cE9Q6B2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc85cE9Q6B2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc85cE9Q6B2 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc85cE9Q6B2 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc85cE9Q6B2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc85cE9Q6B2 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc85cE9Q6B2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc85cE9Q6B2 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc85cE9Q6B2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc85cE9Q6B2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc85cE9Q6B2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc85cE9Q6B2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc85cE9Q6B2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc85cE9Q6B2 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc85cE9Q6B2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc85cE9Q6B2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc85cE9Q6B2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc85cE9Q6B2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc85cE9Q6B2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc85cE9Q6B2 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc85cE9Q6B2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc85cE9Q6B2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc85cE9Q6B2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc85cE9Q6B2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc85cE9Q6B2 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc85cE9Q6B2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc85cE9Q6B2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc85cE9Q6B2 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc85cE9Q6B2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc85cE9Q6B2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc85cE9Q6B2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc85cE9Q6B2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc85cE9Q6B2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc85cE9Q6B2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc85cE9Q6B2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc85cE9Q6B2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc85cE9Q6B2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc85cE9Q6B2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc85cE9Q6B2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc85cE9Q6B2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc85cE9Q6B2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc85cE9Q6B2 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc85cE9Q6B2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc85cE9Q6B2 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc85cE9Q6B2 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc85cE9Q6B2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc85cE9Q6B2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc85cE9Q6B2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc85cE9Q6B2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc85cE9Q6B2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc85cE9Q6B2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc85cE9Q6B2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc85cE9Q6B2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc85cE9Q6B2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc85cE9Q6B2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc85cE9Q6B2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc85cE9Q6B2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc85cE9Q6B2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc85cE9Q6B2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc85cE9Q6B2 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc85cE9Q6B2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc85cE9Q6B2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc85cE9Q6B2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc85cE9Q6B2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc85cE9Q6B2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc85cE9Q6B2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc85cE9Q6B2 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc85cE9Q6B2 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc85cE9Q6B2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc85cE9Q6B2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc85cE9Q6B2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc85cE9Q6B2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc85cE9Q6B2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc85cE9Q6B2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc85cE9Q6B2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc85cE9Q6B2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc85cE9Q6B2 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc85cE9Q6B2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms