Protein–RNA interactions for Protein: E9Q623

BC051665, cDNA sequence BC051665, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051665E9Q623 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BC051665E9Q623 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BC051665E9Q623 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BC051665E9Q623 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BC051665E9Q623 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BC051665E9Q623 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BC051665E9Q623 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BC051665E9Q623 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BC051665E9Q623 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BC051665E9Q623 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BC051665E9Q623 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BC051665E9Q623 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BC051665E9Q623 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BC051665E9Q623 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BC051665E9Q623 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BC051665E9Q623 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BC051665E9Q623 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
BC051665E9Q623 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BC051665E9Q623 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BC051665E9Q623 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BC051665E9Q623 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BC051665E9Q623 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BC051665E9Q623 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BC051665E9Q623 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BC051665E9Q623 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BC051665E9Q623 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BC051665E9Q623 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BC051665E9Q623 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BC051665E9Q623 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BC051665E9Q623 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BC051665E9Q623 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BC051665E9Q623 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BC051665E9Q623 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BC051665E9Q623 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BC051665E9Q623 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BC051665E9Q623 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BC051665E9Q623 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BC051665E9Q623 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BC051665E9Q623 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BC051665E9Q623 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BC051665E9Q623 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BC051665E9Q623 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BC051665E9Q623 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BC051665E9Q623 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BC051665E9Q623 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BC051665E9Q623 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BC051665E9Q623 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BC051665E9Q623 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BC051665E9Q623 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BC051665E9Q623 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BC051665E9Q623 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BC051665E9Q623 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BC051665E9Q623 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BC051665E9Q623 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BC051665E9Q623 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BC051665E9Q623 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BC051665E9Q623 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BC051665E9Q623 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BC051665E9Q623 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BC051665E9Q623 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BC051665E9Q623 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BC051665E9Q623 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BC051665E9Q623 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BC051665E9Q623 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BC051665E9Q623 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BC051665E9Q623 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BC051665E9Q623 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BC051665E9Q623 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BC051665E9Q623 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BC051665E9Q623 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BC051665E9Q623 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BC051665E9Q623 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BC051665E9Q623 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BC051665E9Q623 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BC051665E9Q623 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BC051665E9Q623 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BC051665E9Q623 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BC051665E9Q623 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BC051665E9Q623 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BC051665E9Q623 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BC051665E9Q623 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BC051665E9Q623 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BC051665E9Q623 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BC051665E9Q623 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BC051665E9Q623 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BC051665E9Q623 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BC051665E9Q623 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BC051665E9Q623 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BC051665E9Q623 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BC051665E9Q623 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BC051665E9Q623 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BC051665E9Q623 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BC051665E9Q623 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BC051665E9Q623 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BC051665E9Q623 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BC051665E9Q623 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BC051665E9Q623 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BC051665E9Q623 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BC051665E9Q623 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BC051665E9Q623 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms