Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4Y8

8030474K03Rik, RIKEN cDNA 8030474K03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
8030474K03RikE9Q4Y8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
8030474K03RikE9Q4Y8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
8030474K03RikE9Q4Y8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
8030474K03RikE9Q4Y8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
8030474K03RikE9Q4Y8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
8030474K03RikE9Q4Y8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
8030474K03RikE9Q4Y8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
8030474K03RikE9Q4Y8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
8030474K03RikE9Q4Y8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
8030474K03RikE9Q4Y8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
8030474K03RikE9Q4Y8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
8030474K03RikE9Q4Y8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
8030474K03RikE9Q4Y8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
8030474K03RikE9Q4Y8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
8030474K03RikE9Q4Y8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
8030474K03RikE9Q4Y8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
8030474K03RikE9Q4Y8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
8030474K03RikE9Q4Y8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
8030474K03RikE9Q4Y8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
8030474K03RikE9Q4Y8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
8030474K03RikE9Q4Y8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
8030474K03RikE9Q4Y8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
8030474K03RikE9Q4Y8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
8030474K03RikE9Q4Y8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
8030474K03RikE9Q4Y8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
8030474K03RikE9Q4Y8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
8030474K03RikE9Q4Y8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
8030474K03RikE9Q4Y8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
8030474K03RikE9Q4Y8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
8030474K03RikE9Q4Y8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
8030474K03RikE9Q4Y8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
8030474K03RikE9Q4Y8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
8030474K03RikE9Q4Y8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
8030474K03RikE9Q4Y8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
8030474K03RikE9Q4Y8 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
8030474K03RikE9Q4Y8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
8030474K03RikE9Q4Y8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
8030474K03RikE9Q4Y8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
8030474K03RikE9Q4Y8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms