Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ApobE9Q414 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
ApobE9Q414 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms