Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3E1

Aldh3b2, Aldehyde dehydrogenase family 3 member B2, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh3b2E9Q3E1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aldh3b2E9Q3E1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aldh3b2E9Q3E1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms