Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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Zfp558E9Q1J0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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Zfp558E9Q1J0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Zfp558E9Q1J0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Zfp558E9Q1J0 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Zfp558E9Q1J0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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Zfp558E9Q1J0 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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Zfp558E9Q1J0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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Zfp558E9Q1J0 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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Zfp558E9Q1J0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zfp558E9Q1J0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zfp558E9Q1J0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zfp558E9Q1J0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zfp558E9Q1J0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zfp558E9Q1J0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zfp558E9Q1J0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zfp558E9Q1J0 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zfp558E9Q1J0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Zfp558E9Q1J0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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