Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0V3

Vmn1r68, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r68E9Q0V3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r68E9Q0V3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r68E9Q0V3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r68E9Q0V3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r68E9Q0V3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r68E9Q0V3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r68E9Q0V3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r68E9Q0V3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r68E9Q0V3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r68E9Q0V3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r68E9Q0V3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r68E9Q0V3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r68E9Q0V3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r68E9Q0V3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r68E9Q0V3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r68E9Q0V3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r68E9Q0V3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r68E9Q0V3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r68E9Q0V3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r68E9Q0V3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r68E9Q0V3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r68E9Q0V3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r68E9Q0V3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r68E9Q0V3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r68E9Q0V3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r68E9Q0V3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r68E9Q0V3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r68E9Q0V3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r68E9Q0V3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r68E9Q0V3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r68E9Q0V3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r68E9Q0V3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms