Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Krt78E9Q0F0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt78E9Q0F0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt78E9Q0F0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt78E9Q0F0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt78E9Q0F0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt78E9Q0F0 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt78E9Q0F0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt78E9Q0F0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt78E9Q0F0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt78E9Q0F0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt78E9Q0F0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt78E9Q0F0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt78E9Q0F0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt78E9Q0F0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt78E9Q0F0 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt78E9Q0F0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt78E9Q0F0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt78E9Q0F0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt78E9Q0F0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt78E9Q0F0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt78E9Q0F0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt78E9Q0F0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt78E9Q0F0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt78E9Q0F0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt78E9Q0F0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt78E9Q0F0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt78E9Q0F0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt78E9Q0F0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt78E9Q0F0 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt78E9Q0F0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt78E9Q0F0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt78E9Q0F0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt78E9Q0F0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt78E9Q0F0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt78E9Q0F0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt78E9Q0F0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt78E9Q0F0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt78E9Q0F0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt78E9Q0F0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt78E9Q0F0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt78E9Q0F0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt78E9Q0F0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt78E9Q0F0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt78E9Q0F0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt78E9Q0F0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt78E9Q0F0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt78E9Q0F0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt78E9Q0F0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt78E9Q0F0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt78E9Q0F0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt78E9Q0F0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt78E9Q0F0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt78E9Q0F0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt78E9Q0F0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt78E9Q0F0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt78E9Q0F0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt78E9Q0F0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt78E9Q0F0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt78E9Q0F0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt78E9Q0F0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt78E9Q0F0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt78E9Q0F0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt78E9Q0F0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt78E9Q0F0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt78E9Q0F0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt78E9Q0F0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt78E9Q0F0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt78E9Q0F0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt78E9Q0F0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt78E9Q0F0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt78E9Q0F0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt78E9Q0F0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt78E9Q0F0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt78E9Q0F0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt78E9Q0F0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt78E9Q0F0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt78E9Q0F0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt78E9Q0F0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt78E9Q0F0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt78E9Q0F0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt78E9Q0F0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt78E9Q0F0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt78E9Q0F0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt78E9Q0F0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt78E9Q0F0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt78E9Q0F0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt78E9Q0F0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt78E9Q0F0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt78E9Q0F0 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt78E9Q0F0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt78E9Q0F0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt78E9Q0F0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt78E9Q0F0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt78E9Q0F0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt78E9Q0F0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt78E9Q0F0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt78E9Q0F0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt78E9Q0F0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt78E9Q0F0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms