Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gcom1E9PZ54 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms