Protein–RNA interactions for Protein: E9PX29

Sptbn4, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn4E9PX29 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sptbn4E9PX29 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sptbn4E9PX29 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sptbn4E9PX29 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sptbn4E9PX29 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sptbn4E9PX29 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sptbn4E9PX29 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sptbn4E9PX29 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sptbn4E9PX29 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sptbn4E9PX29 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sptbn4E9PX29 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sptbn4E9PX29 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sptbn4E9PX29 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sptbn4E9PX29 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sptbn4E9PX29 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sptbn4E9PX29 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sptbn4E9PX29 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sptbn4E9PX29 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sptbn4E9PX29 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sptbn4E9PX29 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sptbn4E9PX29 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sptbn4E9PX29 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sptbn4E9PX29 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sptbn4E9PX29 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sptbn4E9PX29 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sptbn4E9PX29 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sptbn4E9PX29 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sptbn4E9PX29 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sptbn4E9PX29 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sptbn4E9PX29 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sptbn4E9PX29 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sptbn4E9PX29 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sptbn4E9PX29 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sptbn4E9PX29 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sptbn4E9PX29 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sptbn4E9PX29 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sptbn4E9PX29 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sptbn4E9PX29 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sptbn4E9PX29 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sptbn4E9PX29 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sptbn4E9PX29 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sptbn4E9PX29 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sptbn4E9PX29 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sptbn4E9PX29 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sptbn4E9PX29 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sptbn4E9PX29 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sptbn4E9PX29 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sptbn4E9PX29 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sptbn4E9PX29 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sptbn4E9PX29 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sptbn4E9PX29 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sptbn4E9PX29 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sptbn4E9PX29 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sptbn4E9PX29 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sptbn4E9PX29 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sptbn4E9PX29 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sptbn4E9PX29 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sptbn4E9PX29 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sptbn4E9PX29 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sptbn4E9PX29 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sptbn4E9PX29 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sptbn4E9PX29 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sptbn4E9PX29 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sptbn4E9PX29 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sptbn4E9PX29 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sptbn4E9PX29 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sptbn4E9PX29 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sptbn4E9PX29 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sptbn4E9PX29 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sptbn4E9PX29 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sptbn4E9PX29 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sptbn4E9PX29 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sptbn4E9PX29 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sptbn4E9PX29 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sptbn4E9PX29 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sptbn4E9PX29 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sptbn4E9PX29 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sptbn4E9PX29 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sptbn4E9PX29 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sptbn4E9PX29 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sptbn4E9PX29 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sptbn4E9PX29 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sptbn4E9PX29 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sptbn4E9PX29 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sptbn4E9PX29 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sptbn4E9PX29 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sptbn4E9PX29 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sptbn4E9PX29 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sptbn4E9PX29 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sptbn4E9PX29 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sptbn4E9PX29 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sptbn4E9PX29 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sptbn4E9PX29 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sptbn4E9PX29 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sptbn4E9PX29 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sptbn4E9PX29 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sptbn4E9PX29 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sptbn4E9PX29 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sptbn4E9PX29 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sptbn4E9PX29 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms