Protein–RNA interactions for Protein: E9PWZ3

Rpl3l, Ribosomal protein L3-like, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3lE9PWZ3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl3lE9PWZ3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms