Protein–RNA interactions for Protein: E9PWL0

Trim30d, Tripartite motif-containing 30D, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30dE9PWL0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim30dE9PWL0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trim30dE9PWL0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trim30dE9PWL0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim30dE9PWL0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim30dE9PWL0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim30dE9PWL0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim30dE9PWL0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim30dE9PWL0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim30dE9PWL0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim30dE9PWL0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim30dE9PWL0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim30dE9PWL0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim30dE9PWL0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim30dE9PWL0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim30dE9PWL0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim30dE9PWL0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim30dE9PWL0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim30dE9PWL0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim30dE9PWL0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim30dE9PWL0 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim30dE9PWL0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim30dE9PWL0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim30dE9PWL0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim30dE9PWL0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim30dE9PWL0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim30dE9PWL0 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim30dE9PWL0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim30dE9PWL0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim30dE9PWL0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim30dE9PWL0 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim30dE9PWL0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim30dE9PWL0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim30dE9PWL0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim30dE9PWL0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim30dE9PWL0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim30dE9PWL0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim30dE9PWL0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim30dE9PWL0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim30dE9PWL0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim30dE9PWL0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim30dE9PWL0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim30dE9PWL0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim30dE9PWL0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim30dE9PWL0 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim30dE9PWL0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim30dE9PWL0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim30dE9PWL0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim30dE9PWL0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim30dE9PWL0 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim30dE9PWL0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim30dE9PWL0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim30dE9PWL0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim30dE9PWL0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim30dE9PWL0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim30dE9PWL0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim30dE9PWL0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim30dE9PWL0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim30dE9PWL0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim30dE9PWL0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim30dE9PWL0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms