Protein–RNA interactions for Protein: E9PUD6

Zscan18, Zinc finger and SCAN domain-containing 18, mousemouse

Predictions only

Length 809 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan18E9PUD6 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Zscan18E9PUD6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zscan18E9PUD6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Zscan18E9PUD6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Zscan18E9PUD6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zscan18E9PUD6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zscan18E9PUD6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zscan18E9PUD6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Zscan18E9PUD6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zscan18E9PUD6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zscan18E9PUD6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zscan18E9PUD6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zscan18E9PUD6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zscan18E9PUD6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zscan18E9PUD6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Zscan18E9PUD6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zscan18E9PUD6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zscan18E9PUD6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zscan18E9PUD6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zscan18E9PUD6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zscan18E9PUD6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zscan18E9PUD6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Zscan18E9PUD6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zscan18E9PUD6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zscan18E9PUD6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Zscan18E9PUD6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Zscan18E9PUD6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zscan18E9PUD6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zscan18E9PUD6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zscan18E9PUD6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Zscan18E9PUD6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Zscan18E9PUD6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zscan18E9PUD6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zscan18E9PUD6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zscan18E9PUD6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zscan18E9PUD6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Zscan18E9PUD6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zscan18E9PUD6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zscan18E9PUD6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zscan18E9PUD6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zscan18E9PUD6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zscan18E9PUD6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zscan18E9PUD6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zscan18E9PUD6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zscan18E9PUD6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zscan18E9PUD6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zscan18E9PUD6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zscan18E9PUD6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zscan18E9PUD6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zscan18E9PUD6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zscan18E9PUD6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zscan18E9PUD6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zscan18E9PUD6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zscan18E9PUD6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Zscan18E9PUD6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zscan18E9PUD6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zscan18E9PUD6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zscan18E9PUD6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zscan18E9PUD6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Zscan18E9PUD6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zscan18E9PUD6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zscan18E9PUD6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zscan18E9PUD6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zscan18E9PUD6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zscan18E9PUD6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zscan18E9PUD6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zscan18E9PUD6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zscan18E9PUD6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zscan18E9PUD6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zscan18E9PUD6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Zscan18E9PUD6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zscan18E9PUD6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zscan18E9PUD6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zscan18E9PUD6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zscan18E9PUD6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zscan18E9PUD6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zscan18E9PUD6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zscan18E9PUD6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zscan18E9PUD6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zscan18E9PUD6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zscan18E9PUD6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zscan18E9PUD6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zscan18E9PUD6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zscan18E9PUD6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zscan18E9PUD6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zscan18E9PUD6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zscan18E9PUD6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zscan18E9PUD6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Zscan18E9PUD6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zscan18E9PUD6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zscan18E9PUD6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zscan18E9PUD6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zscan18E9PUD6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zscan18E9PUD6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zscan18E9PUD6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zscan18E9PUD6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Zscan18E9PUD6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zscan18E9PUD6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Zscan18E9PUD6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zscan18E9PUD6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms