Protein–RNA interactions for Protein: E2JF22

Piezo1, Piezo-type mechanosensitive ion channel component 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Piezo1E2JF22 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Piezo1E2JF22 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Piezo1E2JF22 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Piezo1E2JF22 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Piezo1E2JF22 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Piezo1E2JF22 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Piezo1E2JF22 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Piezo1E2JF22 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Piezo1E2JF22 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Piezo1E2JF22 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Piezo1E2JF22 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Piezo1E2JF22 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Piezo1E2JF22 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Piezo1E2JF22 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Piezo1E2JF22 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Piezo1E2JF22 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Piezo1E2JF22 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Piezo1E2JF22 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Piezo1E2JF22 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Piezo1E2JF22 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Piezo1E2JF22 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Piezo1E2JF22 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Piezo1E2JF22 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Piezo1E2JF22 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Piezo1E2JF22 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Piezo1E2JF22 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Piezo1E2JF22 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Piezo1E2JF22 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Piezo1E2JF22 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Piezo1E2JF22 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Piezo1E2JF22 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Piezo1E2JF22 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Piezo1E2JF22 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Piezo1E2JF22 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Piezo1E2JF22 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Piezo1E2JF22 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Piezo1E2JF22 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Piezo1E2JF22 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Piezo1E2JF22 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Piezo1E2JF22 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Piezo1E2JF22 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Piezo1E2JF22 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Piezo1E2JF22 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Piezo1E2JF22 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Piezo1E2JF22 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Piezo1E2JF22 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Piezo1E2JF22 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Piezo1E2JF22 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Piezo1E2JF22 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Piezo1E2JF22 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Piezo1E2JF22 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Piezo1E2JF22 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Piezo1E2JF22 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Piezo1E2JF22 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Piezo1E2JF22 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Piezo1E2JF22 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Piezo1E2JF22 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Piezo1E2JF22 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Piezo1E2JF22 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Piezo1E2JF22 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Piezo1E2JF22 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Piezo1E2JF22 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Piezo1E2JF22 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Piezo1E2JF22 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Piezo1E2JF22 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Piezo1E2JF22 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Piezo1E2JF22 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Piezo1E2JF22 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Piezo1E2JF22 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Piezo1E2JF22 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Piezo1E2JF22 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Piezo1E2JF22 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Piezo1E2JF22 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Piezo1E2JF22 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Piezo1E2JF22 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Piezo1E2JF22 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Piezo1E2JF22 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Piezo1E2JF22 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Piezo1E2JF22 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Piezo1E2JF22 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Piezo1E2JF22 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Piezo1E2JF22 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Piezo1E2JF22 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Piezo1E2JF22 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Piezo1E2JF22 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Piezo1E2JF22 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Piezo1E2JF22 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Piezo1E2JF22 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Piezo1E2JF22 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Piezo1E2JF22 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Piezo1E2JF22 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Piezo1E2JF22 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Piezo1E2JF22 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Piezo1E2JF22 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Piezo1E2JF22 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Piezo1E2JF22 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Piezo1E2JF22 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Piezo1E2JF22 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Piezo1E2JF22 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Piezo1E2JF22 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms