Protein–RNA interactions for Protein: D3Z460

Gm1330, Predicted gene 1330, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1330D3Z460 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm1330D3Z460 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms