Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms