Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3543D3Z235 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3543D3Z235 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3543D3Z235 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3543D3Z235 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3543D3Z235 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3543D3Z235 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3543D3Z235 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3543D3Z235 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3543D3Z235 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3543D3Z235 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3543D3Z235 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3543D3Z235 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3543D3Z235 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3543D3Z235 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm3543D3Z235 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3543D3Z235 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3543D3Z235 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3543D3Z235 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3543D3Z235 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3543D3Z235 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3543D3Z235 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3543D3Z235 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3543D3Z235 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3543D3Z235 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3543D3Z235 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3543D3Z235 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3543D3Z235 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3543D3Z235 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3543D3Z235 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3543D3Z235 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3543D3Z235 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3543D3Z235 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3543D3Z235 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3543D3Z235 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3543D3Z235 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3543D3Z235 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3543D3Z235 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3543D3Z235 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3543D3Z235 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3543D3Z235 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3543D3Z235 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3543D3Z235 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3543D3Z235 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3543D3Z235 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3543D3Z235 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3543D3Z235 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3543D3Z235 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3543D3Z235 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3543D3Z235 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3543D3Z235 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3543D3Z235 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3543D3Z235 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3543D3Z235 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3543D3Z235 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3543D3Z235 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3543D3Z235 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3543D3Z235 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3543D3Z235 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3543D3Z235 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3543D3Z235 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3543D3Z235 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3543D3Z235 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3543D3Z235 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3543D3Z235 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3543D3Z235 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3543D3Z235 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3543D3Z235 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3543D3Z235 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3543D3Z235 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3543D3Z235 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3543D3Z235 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3543D3Z235 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3543D3Z235 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3543D3Z235 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3543D3Z235 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3543D3Z235 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3543D3Z235 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3543D3Z235 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3543D3Z235 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3543D3Z235 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3543D3Z235 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3543D3Z235 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3543D3Z235 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3543D3Z235 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3543D3Z235 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3543D3Z235 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3543D3Z235 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3543D3Z235 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3543D3Z235 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3543D3Z235 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3543D3Z235 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3543D3Z235 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3543D3Z235 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3543D3Z235 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3543D3Z235 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3543D3Z235 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3543D3Z235 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3543D3Z235 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3543D3Z235 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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