Protein–RNA interactions for Protein: D3Z0P8

Tmem200b, Transmembrane protein 200B, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200bD3Z0P8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem200bD3Z0P8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem200bD3Z0P8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms