Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc6D3YZP9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc6D3YZP9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc6D3YZP9 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc6D3YZP9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc6D3YZP9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc6D3YZP9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc6D3YZP9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc6D3YZP9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc6D3YZP9 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc6D3YZP9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc6D3YZP9 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc6D3YZP9 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc6D3YZP9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc6D3YZP9 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc6D3YZP9 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc6D3YZP9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc6D3YZP9 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc6D3YZP9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc6D3YZP9 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc6D3YZP9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc6D3YZP9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc6D3YZP9 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc6D3YZP9 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc6D3YZP9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc6D3YZP9 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc6D3YZP9 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc6D3YZP9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc6D3YZP9 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc6D3YZP9 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc6D3YZP9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc6D3YZP9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc6D3YZP9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc6D3YZP9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc6D3YZP9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc6D3YZP9 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc6D3YZP9 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc6D3YZP9 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc6D3YZP9 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc6D3YZP9 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc6D3YZP9 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc6D3YZP9 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc6D3YZP9 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc6D3YZP9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc6D3YZP9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc6D3YZP9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ccdc6D3YZP9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc6D3YZP9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc6D3YZP9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc6D3YZP9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc6D3YZP9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc6D3YZP9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc6D3YZP9 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc6D3YZP9 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc6D3YZP9 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc6D3YZP9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc6D3YZP9 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc6D3YZP9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc6D3YZP9 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc6D3YZP9 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc6D3YZP9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc6D3YZP9 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc6D3YZP9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc6D3YZP9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc6D3YZP9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc6D3YZP9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc6D3YZP9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc6D3YZP9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc6D3YZP9 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc6D3YZP9 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc6D3YZP9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc6D3YZP9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc6D3YZP9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc6D3YZP9 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc6D3YZP9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc6D3YZP9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc6D3YZP9 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc6D3YZP9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc6D3YZP9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc6D3YZP9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc6D3YZP9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc6D3YZP9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc6D3YZP9 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc6D3YZP9 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc6D3YZP9 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc6D3YZP9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc6D3YZP9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc6D3YZP9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc6D3YZP9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc6D3YZP9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc6D3YZP9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc6D3YZP9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc6D3YZP9 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc6D3YZP9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc6D3YZP9 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc6D3YZP9 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc6D3YZP9 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc6D3YZP9 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc6D3YZP9 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms