Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Kif28pD3YXS5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kif28pD3YXS5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms