Protein–RNA interactions for Protein: D3YW29

Rexo5, RNA exonuclease 5, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo5D3YW29 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rexo5D3YW29 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rexo5D3YW29 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rexo5D3YW29 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rexo5D3YW29 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rexo5D3YW29 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rexo5D3YW29 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rexo5D3YW29 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rexo5D3YW29 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rexo5D3YW29 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rexo5D3YW29 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rexo5D3YW29 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rexo5D3YW29 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Rexo5D3YW29 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rexo5D3YW29 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rexo5D3YW29 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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Rexo5D3YW29 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rexo5D3YW29 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rexo5D3YW29 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rexo5D3YW29 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rexo5D3YW29 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rexo5D3YW29 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rexo5D3YW29 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rexo5D3YW29 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rexo5D3YW29 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rexo5D3YW29 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rexo5D3YW29 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rexo5D3YW29 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rexo5D3YW29 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rexo5D3YW29 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rexo5D3YW29 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rexo5D3YW29 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rexo5D3YW29 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Rexo5D3YW29 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Rexo5D3YW29 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rexo5D3YW29 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rexo5D3YW29 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rexo5D3YW29 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rexo5D3YW29 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rexo5D3YW29 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rexo5D3YW29 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rexo5D3YW29 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rexo5D3YW29 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Rexo5D3YW29 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rexo5D3YW29 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rexo5D3YW29 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rexo5D3YW29 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rexo5D3YW29 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Rexo5D3YW29 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rexo5D3YW29 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rexo5D3YW29 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rexo5D3YW29 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rexo5D3YW29 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rexo5D3YW29 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rexo5D3YW29 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rexo5D3YW29 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rexo5D3YW29 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rexo5D3YW29 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rexo5D3YW29 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rexo5D3YW29 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rexo5D3YW29 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rexo5D3YW29 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rexo5D3YW29 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Rexo5D3YW29 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rexo5D3YW29 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Rexo5D3YW29 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rexo5D3YW29 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rexo5D3YW29 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rexo5D3YW29 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Rexo5D3YW29 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rexo5D3YW29 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rexo5D3YW29 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rexo5D3YW29 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Rexo5D3YW29 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rexo5D3YW29 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rexo5D3YW29 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rexo5D3YW29 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rexo5D3YW29 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rexo5D3YW29 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rexo5D3YW29 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rexo5D3YW29 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rexo5D3YW29 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rexo5D3YW29 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rexo5D3YW29 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Rexo5D3YW29 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rexo5D3YW29 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Rexo5D3YW29 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rexo5D3YW29 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rexo5D3YW29 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rexo5D3YW29 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rexo5D3YW29 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rexo5D3YW29 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rexo5D3YW29 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rexo5D3YW29 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rexo5D3YW29 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rexo5D3YW29 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rexo5D3YW29 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rexo5D3YW29 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rexo5D3YW29 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms