Protein–RNA interactions for Protein: D3YUM8

Gm4950, Proteasome subunit beta type, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4950D3YUM8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Gm4950D3YUM8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm4950D3YUM8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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