Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ57

Mterf1b, Transcription termination factor 1b, mitochondrial, mousemouse

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1bB9EJ57 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mterf1bB9EJ57 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Mterf1bB9EJ57 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mterf1bB9EJ57 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mterf1bB9EJ57 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mterf1bB9EJ57 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mterf1bB9EJ57 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mterf1bB9EJ57 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mterf1bB9EJ57 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mterf1bB9EJ57 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mterf1bB9EJ57 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mterf1bB9EJ57 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mterf1bB9EJ57 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mterf1bB9EJ57 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mterf1bB9EJ57 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mterf1bB9EJ57 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Mterf1bB9EJ57 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
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Mterf1bB9EJ57 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Mterf1bB9EJ57 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
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Mterf1bB9EJ57 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mterf1bB9EJ57 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mterf1bB9EJ57 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mterf1bB9EJ57 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
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Mterf1bB9EJ57 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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Mterf1bB9EJ57 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
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Mterf1bB9EJ57 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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Mterf1bB9EJ57 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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Mterf1bB9EJ57 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
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Mterf1bB9EJ57 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mterf1bB9EJ57 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Mterf1bB9EJ57 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mterf1bB9EJ57 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mterf1bB9EJ57 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mterf1bB9EJ57 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mterf1bB9EJ57 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mterf1bB9EJ57 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mterf1bB9EJ57 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mterf1bB9EJ57 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mterf1bB9EJ57 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mterf1bB9EJ57 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mterf1bB9EJ57 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mterf1bB9EJ57 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mterf1bB9EJ57 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mterf1bB9EJ57 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mterf1bB9EJ57 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mterf1bB9EJ57 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mterf1bB9EJ57 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mterf1bB9EJ57 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mterf1bB9EJ57 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mterf1bB9EJ57 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mterf1bB9EJ57 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mterf1bB9EJ57 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mterf1bB9EJ57 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mterf1bB9EJ57 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Mterf1bB9EJ57 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mterf1bB9EJ57 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mterf1bB9EJ57 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms