Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clip3B9EHT4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clip3B9EHT4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clip3B9EHT4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clip3B9EHT4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clip3B9EHT4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clip3B9EHT4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clip3B9EHT4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clip3B9EHT4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clip3B9EHT4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clip3B9EHT4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clip3B9EHT4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clip3B9EHT4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clip3B9EHT4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clip3B9EHT4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clip3B9EHT4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clip3B9EHT4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clip3B9EHT4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clip3B9EHT4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clip3B9EHT4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clip3B9EHT4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clip3B9EHT4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clip3B9EHT4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clip3B9EHT4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clip3B9EHT4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clip3B9EHT4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Clip3B9EHT4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clip3B9EHT4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Clip3B9EHT4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clip3B9EHT4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clip3B9EHT4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clip3B9EHT4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clip3B9EHT4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clip3B9EHT4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clip3B9EHT4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clip3B9EHT4 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clip3B9EHT4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clip3B9EHT4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clip3B9EHT4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clip3B9EHT4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clip3B9EHT4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clip3B9EHT4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clip3B9EHT4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clip3B9EHT4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clip3B9EHT4 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clip3B9EHT4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Clip3B9EHT4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clip3B9EHT4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clip3B9EHT4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clip3B9EHT4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clip3B9EHT4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clip3B9EHT4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clip3B9EHT4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clip3B9EHT4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clip3B9EHT4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clip3B9EHT4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clip3B9EHT4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clip3B9EHT4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Clip3B9EHT4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clip3B9EHT4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clip3B9EHT4 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Clip3B9EHT4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Clip3B9EHT4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clip3B9EHT4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clip3B9EHT4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clip3B9EHT4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clip3B9EHT4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clip3B9EHT4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clip3B9EHT4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clip3B9EHT4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clip3B9EHT4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clip3B9EHT4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clip3B9EHT4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clip3B9EHT4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clip3B9EHT4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clip3B9EHT4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clip3B9EHT4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clip3B9EHT4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Clip3B9EHT4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clip3B9EHT4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clip3B9EHT4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clip3B9EHT4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clip3B9EHT4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clip3B9EHT4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clip3B9EHT4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Clip3B9EHT4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clip3B9EHT4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clip3B9EHT4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clip3B9EHT4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clip3B9EHT4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clip3B9EHT4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clip3B9EHT4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clip3B9EHT4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clip3B9EHT4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clip3B9EHT4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clip3B9EHT4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clip3B9EHT4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clip3B9EHT4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Clip3B9EHT4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Clip3B9EHT4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms