Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Siah3B2RWG3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Siah3B2RWG3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Siah3B2RWG3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Siah3B2RWG3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Siah3B2RWG3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Siah3B2RWG3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Siah3B2RWG3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Siah3B2RWG3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Siah3B2RWG3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Siah3B2RWG3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Siah3B2RWG3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Siah3B2RWG3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Siah3B2RWG3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Siah3B2RWG3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Siah3B2RWG3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Siah3B2RWG3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Siah3B2RWG3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Siah3B2RWG3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Siah3B2RWG3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Siah3B2RWG3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Siah3B2RWG3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Siah3B2RWG3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Siah3B2RWG3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Siah3B2RWG3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Siah3B2RWG3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Siah3B2RWG3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Siah3B2RWG3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Siah3B2RWG3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Siah3B2RWG3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Siah3B2RWG3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Siah3B2RWG3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Siah3B2RWG3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Siah3B2RWG3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Siah3B2RWG3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Siah3B2RWG3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Siah3B2RWG3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Siah3B2RWG3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Siah3B2RWG3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Siah3B2RWG3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Siah3B2RWG3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Siah3B2RWG3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Siah3B2RWG3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Siah3B2RWG3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Siah3B2RWG3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Siah3B2RWG3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Siah3B2RWG3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Siah3B2RWG3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Siah3B2RWG3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Siah3B2RWG3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Siah3B2RWG3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Siah3B2RWG3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Siah3B2RWG3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Siah3B2RWG3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Siah3B2RWG3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Siah3B2RWG3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Siah3B2RWG3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Siah3B2RWG3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Siah3B2RWG3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Siah3B2RWG3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Siah3B2RWG3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Siah3B2RWG3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Siah3B2RWG3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Siah3B2RWG3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Siah3B2RWG3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Siah3B2RWG3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Siah3B2RWG3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Siah3B2RWG3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Siah3B2RWG3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Siah3B2RWG3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Siah3B2RWG3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Siah3B2RWG3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Siah3B2RWG3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Siah3B2RWG3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Siah3B2RWG3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Siah3B2RWG3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Siah3B2RWG3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Siah3B2RWG3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Siah3B2RWG3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Siah3B2RWG3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Siah3B2RWG3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Siah3B2RWG3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Siah3B2RWG3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Siah3B2RWG3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Siah3B2RWG3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Siah3B2RWG3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Siah3B2RWG3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Siah3B2RWG3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Siah3B2RWG3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Siah3B2RWG3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Siah3B2RWG3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Siah3B2RWG3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Siah3B2RWG3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Siah3B2RWG3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Siah3B2RWG3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Siah3B2RWG3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Siah3B2RWG3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Siah3B2RWG3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Siah3B2RWG3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Siah3B2RWG3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms