Protein–RNA interactions for Protein: B2RVB7

Hbb-bh2, Globin b2, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbb-bh2B2RVB7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hbb-bh2B2RVB7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hbb-bh2B2RVB7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms