Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rd3lB2RV38 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rd3lB2RV38 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms