Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AU015836B2RUM3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AU015836B2RUM3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AU015836B2RUM3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
AU015836B2RUM3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AU015836B2RUM3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AU015836B2RUM3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AU015836B2RUM3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AU015836B2RUM3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AU015836B2RUM3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AU015836B2RUM3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
AU015836B2RUM3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AU015836B2RUM3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AU015836B2RUM3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AU015836B2RUM3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
AU015836B2RUM3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AU015836B2RUM3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AU015836B2RUM3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AU015836B2RUM3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AU015836B2RUM3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AU015836B2RUM3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AU015836B2RUM3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AU015836B2RUM3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AU015836B2RUM3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AU015836B2RUM3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AU015836B2RUM3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AU015836B2RUM3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AU015836B2RUM3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AU015836B2RUM3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AU015836B2RUM3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AU015836B2RUM3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AU015836B2RUM3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AU015836B2RUM3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AU015836B2RUM3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AU015836B2RUM3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AU015836B2RUM3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AU015836B2RUM3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AU015836B2RUM3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AU015836B2RUM3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AU015836B2RUM3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AU015836B2RUM3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AU015836B2RUM3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AU015836B2RUM3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AU015836B2RUM3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AU015836B2RUM3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AU015836B2RUM3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
AU015836B2RUM3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AU015836B2RUM3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AU015836B2RUM3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AU015836B2RUM3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AU015836B2RUM3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AU015836B2RUM3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AU015836B2RUM3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AU015836B2RUM3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AU015836B2RUM3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AU015836B2RUM3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AU015836B2RUM3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AU015836B2RUM3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
AU015836B2RUM3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AU015836B2RUM3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AU015836B2RUM3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AU015836B2RUM3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AU015836B2RUM3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AU015836B2RUM3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AU015836B2RUM3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AU015836B2RUM3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AU015836B2RUM3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AU015836B2RUM3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AU015836B2RUM3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AU015836B2RUM3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AU015836B2RUM3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AU015836B2RUM3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AU015836B2RUM3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AU015836B2RUM3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AU015836B2RUM3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AU015836B2RUM3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AU015836B2RUM3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AU015836B2RUM3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AU015836B2RUM3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
AU015836B2RUM3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AU015836B2RUM3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AU015836B2RUM3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AU015836B2RUM3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AU015836B2RUM3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AU015836B2RUM3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AU015836B2RUM3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AU015836B2RUM3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AU015836B2RUM3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AU015836B2RUM3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AU015836B2RUM3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AU015836B2RUM3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AU015836B2RUM3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AU015836B2RUM3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AU015836B2RUM3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AU015836B2RUM3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AU015836B2RUM3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AU015836B2RUM3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AU015836B2RUM3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AU015836B2RUM3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AU015836B2RUM3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.9 ms