Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtprbB2RU80 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprbB2RU80 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms