Protein–RNA interactions for Protein: B2RQY6

BC035947, BC035947 protein, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035947B2RQY6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BC035947B2RQY6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BC035947B2RQY6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BC035947B2RQY6 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
BC035947B2RQY6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BC035947B2RQY6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BC035947B2RQY6 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BC035947B2RQY6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms