Protein–RNA interactions for Protein: B2RQT2

Vmn1r5, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r5B2RQT2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r5B2RQT2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r5B2RQT2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r5B2RQT2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r5B2RQT2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r5B2RQT2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r5B2RQT2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r5B2RQT2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r5B2RQT2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r5B2RQT2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r5B2RQT2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r5B2RQT2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r5B2RQT2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r5B2RQT2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r5B2RQT2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r5B2RQT2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r5B2RQT2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r5B2RQT2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r5B2RQT2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r5B2RQT2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r5B2RQT2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r5B2RQT2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r5B2RQT2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r5B2RQT2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r5B2RQT2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r5B2RQT2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r5B2RQT2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r5B2RQT2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r5B2RQT2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r5B2RQT2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r5B2RQT2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r5B2RQT2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r5B2RQT2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r5B2RQT2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r5B2RQT2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r5B2RQT2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r5B2RQT2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r5B2RQT2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r5B2RQT2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r5B2RQT2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r5B2RQT2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r5B2RQT2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r5B2RQT2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r5B2RQT2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r5B2RQT2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r5B2RQT2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r5B2RQT2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r5B2RQT2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r5B2RQT2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r5B2RQT2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r5B2RQT2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r5B2RQT2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r5B2RQT2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r5B2RQT2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r5B2RQT2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r5B2RQT2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r5B2RQT2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r5B2RQT2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r5B2RQT2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r5B2RQT2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r5B2RQT2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r5B2RQT2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r5B2RQT2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r5B2RQT2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r5B2RQT2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r5B2RQT2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r5B2RQT2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r5B2RQT2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r5B2RQT2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r5B2RQT2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r5B2RQT2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r5B2RQT2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r5B2RQT2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r5B2RQT2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r5B2RQT2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r5B2RQT2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r5B2RQT2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r5B2RQT2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r5B2RQT2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r5B2RQT2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r5B2RQT2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r5B2RQT2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r5B2RQT2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r5B2RQT2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r5B2RQT2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r5B2RQT2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r5B2RQT2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r5B2RQT2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r5B2RQT2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r5B2RQT2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r5B2RQT2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r5B2RQT2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r5B2RQT2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r5B2RQT2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r5B2RQT2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r5B2RQT2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r5B2RQT2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r5B2RQT2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r5B2RQT2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r5B2RQT2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms