Protein–RNA interactions for Protein: B1AYB6

Mbd5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd5B1AYB6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Mbd5B1AYB6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Mbd5B1AYB6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Mbd5B1AYB6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Mbd5B1AYB6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Mbd5B1AYB6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Mbd5B1AYB6 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Mbd5B1AYB6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Mbd5B1AYB6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Mbd5B1AYB6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Mbd5B1AYB6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Mbd5B1AYB6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Mbd5B1AYB6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Mbd5B1AYB6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Mbd5B1AYB6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Mbd5B1AYB6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Mbd5B1AYB6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Mbd5B1AYB6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Mbd5B1AYB6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Mbd5B1AYB6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Mbd5B1AYB6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Mbd5B1AYB6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Mbd5B1AYB6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Mbd5B1AYB6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Mbd5B1AYB6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Mbd5B1AYB6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Mbd5B1AYB6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Mbd5B1AYB6 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Mbd5B1AYB6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Mbd5B1AYB6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Mbd5B1AYB6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Mbd5B1AYB6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Mbd5B1AYB6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Mbd5B1AYB6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Mbd5B1AYB6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Mbd5B1AYB6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Mbd5B1AYB6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Mbd5B1AYB6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Mbd5B1AYB6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Mbd5B1AYB6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Mbd5B1AYB6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Mbd5B1AYB6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Mbd5B1AYB6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Mbd5B1AYB6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Mbd5B1AYB6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Mbd5B1AYB6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Mbd5B1AYB6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Mbd5B1AYB6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Mbd5B1AYB6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Mbd5B1AYB6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Mbd5B1AYB6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Mbd5B1AYB6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Mbd5B1AYB6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Mbd5B1AYB6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Mbd5B1AYB6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Mbd5B1AYB6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Mbd5B1AYB6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Mbd5B1AYB6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Mbd5B1AYB6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Mbd5B1AYB6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Mbd5B1AYB6 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Mbd5B1AYB6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Mbd5B1AYB6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Mbd5B1AYB6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Mbd5B1AYB6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Mbd5B1AYB6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Mbd5B1AYB6 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Mbd5B1AYB6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Mbd5B1AYB6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Mbd5B1AYB6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Mbd5B1AYB6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Mbd5B1AYB6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Mbd5B1AYB6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Mbd5B1AYB6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Mbd5B1AYB6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Mbd5B1AYB6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Mbd5B1AYB6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Mbd5B1AYB6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Mbd5B1AYB6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Mbd5B1AYB6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Mbd5B1AYB6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Mbd5B1AYB6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Mbd5B1AYB6 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Mbd5B1AYB6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Mbd5B1AYB6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Mbd5B1AYB6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Mbd5B1AYB6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Mbd5B1AYB6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Mbd5B1AYB6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Mbd5B1AYB6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Mbd5B1AYB6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Mbd5B1AYB6 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Mbd5B1AYB6 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Mbd5B1AYB6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Mbd5B1AYB6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Mbd5B1AYB6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Mbd5B1AYB6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Mbd5B1AYB6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Mbd5B1AYB6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Mbd5B1AYB6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms