Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB3

Gm438, MCG65768, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm438B1ASB3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm438B1ASB3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm438B1ASB3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm438B1ASB3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm438B1ASB3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm438B1ASB3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm438B1ASB3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm438B1ASB3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm438B1ASB3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm438B1ASB3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm438B1ASB3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm438B1ASB3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm438B1ASB3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm438B1ASB3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm438B1ASB3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm438B1ASB3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm438B1ASB3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm438B1ASB3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm438B1ASB3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm438B1ASB3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm438B1ASB3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm438B1ASB3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm438B1ASB3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm438B1ASB3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm438B1ASB3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm438B1ASB3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm438B1ASB3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm438B1ASB3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm438B1ASB3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm438B1ASB3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm438B1ASB3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm438B1ASB3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm438B1ASB3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm438B1ASB3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm438B1ASB3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm438B1ASB3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm438B1ASB3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm438B1ASB3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm438B1ASB3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm438B1ASB3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm438B1ASB3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm438B1ASB3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm438B1ASB3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm438B1ASB3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm438B1ASB3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm438B1ASB3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm438B1ASB3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm438B1ASB3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm438B1ASB3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm438B1ASB3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm438B1ASB3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm438B1ASB3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm438B1ASB3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm438B1ASB3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm438B1ASB3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm438B1ASB3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm438B1ASB3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm438B1ASB3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm438B1ASB3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm438B1ASB3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm438B1ASB3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm438B1ASB3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm438B1ASB3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm438B1ASB3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm438B1ASB3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm438B1ASB3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm438B1ASB3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm438B1ASB3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm438B1ASB3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm438B1ASB3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm438B1ASB3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm438B1ASB3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm438B1ASB3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm438B1ASB3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm438B1ASB3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm438B1ASB3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm438B1ASB3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm438B1ASB3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms