Protein–RNA interactions for Protein: B1APN4

Rhox1, Reproductive homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox1B1APN4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rhox1B1APN4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rhox1B1APN4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rhox1B1APN4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rhox1B1APN4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rhox1B1APN4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rhox1B1APN4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rhox1B1APN4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rhox1B1APN4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rhox1B1APN4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rhox1B1APN4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rhox1B1APN4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rhox1B1APN4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rhox1B1APN4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rhox1B1APN4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rhox1B1APN4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rhox1B1APN4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rhox1B1APN4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rhox1B1APN4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rhox1B1APN4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rhox1B1APN4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rhox1B1APN4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rhox1B1APN4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rhox1B1APN4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rhox1B1APN4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rhox1B1APN4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rhox1B1APN4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rhox1B1APN4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rhox1B1APN4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rhox1B1APN4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rhox1B1APN4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rhox1B1APN4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rhox1B1APN4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rhox1B1APN4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rhox1B1APN4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rhox1B1APN4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rhox1B1APN4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rhox1B1APN4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms