Protein–RNA interactions for Protein: A7XUX6

Skint2, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint2A7XUX6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Skint2A7XUX6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms