Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-M5A7VMS3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms