Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms