Protein–RNA interactions for Protein: A6H6T1

Prss40, Serine protease 40, mousemouse

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Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss40A6H6T1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prss40A6H6T1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prss40A6H6T1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prss40A6H6T1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prss40A6H6T1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prss40A6H6T1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Prss40A6H6T1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prss40A6H6T1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prss40A6H6T1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prss40A6H6T1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Prss40A6H6T1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prss40A6H6T1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Prss40A6H6T1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Prss40A6H6T1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prss40A6H6T1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prss40A6H6T1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prss40A6H6T1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prss40A6H6T1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prss40A6H6T1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prss40A6H6T1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prss40A6H6T1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prss40A6H6T1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prss40A6H6T1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prss40A6H6T1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prss40A6H6T1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prss40A6H6T1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prss40A6H6T1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Prss40A6H6T1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prss40A6H6T1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prss40A6H6T1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prss40A6H6T1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prss40A6H6T1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Prss40A6H6T1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prss40A6H6T1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prss40A6H6T1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prss40A6H6T1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Prss40A6H6T1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prss40A6H6T1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prss40A6H6T1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prss40A6H6T1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prss40A6H6T1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prss40A6H6T1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prss40A6H6T1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prss40A6H6T1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prss40A6H6T1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prss40A6H6T1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prss40A6H6T1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prss40A6H6T1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prss40A6H6T1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prss40A6H6T1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prss40A6H6T1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prss40A6H6T1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prss40A6H6T1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prss40A6H6T1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prss40A6H6T1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Prss40A6H6T1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prss40A6H6T1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Prss40A6H6T1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prss40A6H6T1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prss40A6H6T1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prss40A6H6T1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prss40A6H6T1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prss40A6H6T1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prss40A6H6T1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prss40A6H6T1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Prss40A6H6T1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prss40A6H6T1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prss40A6H6T1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prss40A6H6T1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prss40A6H6T1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prss40A6H6T1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prss40A6H6T1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Prss40A6H6T1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prss40A6H6T1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prss40A6H6T1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Prss40A6H6T1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prss40A6H6T1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prss40A6H6T1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prss40A6H6T1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prss40A6H6T1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Prss40A6H6T1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prss40A6H6T1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prss40A6H6T1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prss40A6H6T1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prss40A6H6T1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Prss40A6H6T1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prss40A6H6T1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prss40A6H6T1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prss40A6H6T1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prss40A6H6T1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prss40A6H6T1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Prss40A6H6T1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prss40A6H6T1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prss40A6H6T1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prss40A6H6T1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prss40A6H6T1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prss40A6H6T1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prss40A6H6T1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prss40A6H6T1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prss40A6H6T1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms