Protein–RNA interactions for Protein: A6H6S0

Herc3, Hect domain and RLD 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc3A6H6S0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Herc3A6H6S0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Herc3A6H6S0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Herc3A6H6S0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Herc3A6H6S0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Herc3A6H6S0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Herc3A6H6S0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Herc3A6H6S0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Herc3A6H6S0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Herc3A6H6S0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Herc3A6H6S0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Herc3A6H6S0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Herc3A6H6S0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Herc3A6H6S0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Herc3A6H6S0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Herc3A6H6S0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Herc3A6H6S0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Herc3A6H6S0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Herc3A6H6S0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Herc3A6H6S0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Herc3A6H6S0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Herc3A6H6S0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Herc3A6H6S0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Herc3A6H6S0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Herc3A6H6S0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Herc3A6H6S0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Herc3A6H6S0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Herc3A6H6S0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Herc3A6H6S0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Herc3A6H6S0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Herc3A6H6S0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Herc3A6H6S0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Herc3A6H6S0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Herc3A6H6S0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Herc3A6H6S0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Herc3A6H6S0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Herc3A6H6S0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Herc3A6H6S0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Herc3A6H6S0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Herc3A6H6S0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Herc3A6H6S0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Herc3A6H6S0 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Herc3A6H6S0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Herc3A6H6S0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Herc3A6H6S0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Herc3A6H6S0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Herc3A6H6S0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Herc3A6H6S0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Herc3A6H6S0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Herc3A6H6S0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Herc3A6H6S0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Herc3A6H6S0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Herc3A6H6S0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Herc3A6H6S0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Herc3A6H6S0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Herc3A6H6S0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Herc3A6H6S0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Herc3A6H6S0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Herc3A6H6S0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Herc3A6H6S0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Herc3A6H6S0 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Herc3A6H6S0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Herc3A6H6S0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Herc3A6H6S0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Herc3A6H6S0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Herc3A6H6S0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Herc3A6H6S0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Herc3A6H6S0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Herc3A6H6S0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Herc3A6H6S0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Herc3A6H6S0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Herc3A6H6S0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Herc3A6H6S0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Herc3A6H6S0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Herc3A6H6S0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Herc3A6H6S0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Herc3A6H6S0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Herc3A6H6S0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Herc3A6H6S0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Herc3A6H6S0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Herc3A6H6S0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Herc3A6H6S0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Herc3A6H6S0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Herc3A6H6S0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Herc3A6H6S0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Herc3A6H6S0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Herc3A6H6S0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Herc3A6H6S0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Herc3A6H6S0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Herc3A6H6S0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Herc3A6H6S0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Herc3A6H6S0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Herc3A6H6S0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Herc3A6H6S0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Herc3A6H6S0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Herc3A6H6S0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Herc3A6H6S0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Herc3A6H6S0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Herc3A6H6S0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Herc3A6H6S0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms