Protein–RNA interactions for Protein: A3KMP2

Ttc38, Tetratricopeptide repeat protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc38A3KMP2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttc38A3KMP2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttc38A3KMP2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttc38A3KMP2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttc38A3KMP2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttc38A3KMP2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ttc38A3KMP2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ttc38A3KMP2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ttc38A3KMP2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ttc38A3KMP2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttc38A3KMP2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttc38A3KMP2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttc38A3KMP2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttc38A3KMP2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttc38A3KMP2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttc38A3KMP2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttc38A3KMP2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttc38A3KMP2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttc38A3KMP2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttc38A3KMP2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttc38A3KMP2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttc38A3KMP2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttc38A3KMP2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttc38A3KMP2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttc38A3KMP2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttc38A3KMP2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ttc38A3KMP2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttc38A3KMP2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttc38A3KMP2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ttc38A3KMP2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttc38A3KMP2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttc38A3KMP2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttc38A3KMP2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttc38A3KMP2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttc38A3KMP2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Ttc38A3KMP2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttc38A3KMP2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttc38A3KMP2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttc38A3KMP2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttc38A3KMP2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttc38A3KMP2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttc38A3KMP2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttc38A3KMP2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttc38A3KMP2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttc38A3KMP2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttc38A3KMP2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttc38A3KMP2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttc38A3KMP2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttc38A3KMP2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ttc38A3KMP2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttc38A3KMP2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttc38A3KMP2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttc38A3KMP2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttc38A3KMP2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttc38A3KMP2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttc38A3KMP2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttc38A3KMP2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttc38A3KMP2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttc38A3KMP2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttc38A3KMP2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttc38A3KMP2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttc38A3KMP2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ttc38A3KMP2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc38A3KMP2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc38A3KMP2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc38A3KMP2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc38A3KMP2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc38A3KMP2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc38A3KMP2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc38A3KMP2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc38A3KMP2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc38A3KMP2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc38A3KMP2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc38A3KMP2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc38A3KMP2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc38A3KMP2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ttc38A3KMP2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttc38A3KMP2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttc38A3KMP2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttc38A3KMP2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttc38A3KMP2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttc38A3KMP2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttc38A3KMP2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttc38A3KMP2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttc38A3KMP2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttc38A3KMP2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttc38A3KMP2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttc38A3KMP2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttc38A3KMP2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttc38A3KMP2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttc38A3KMP2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttc38A3KMP2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttc38A3KMP2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttc38A3KMP2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttc38A3KMP2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttc38A3KMP2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttc38A3KMP2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttc38A3KMP2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttc38A3KMP2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ttc38A3KMP2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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