Protein–RNA interactions for Protein: A3KMN5

Prr16, Protein Largen, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr16A3KMN5 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prr16A3KMN5 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Prr16A3KMN5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prr16A3KMN5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Prr16A3KMN5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prr16A3KMN5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prr16A3KMN5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prr16A3KMN5 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Prr16A3KMN5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prr16A3KMN5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Prr16A3KMN5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prr16A3KMN5 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prr16A3KMN5 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Prr16A3KMN5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prr16A3KMN5 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prr16A3KMN5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prr16A3KMN5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prr16A3KMN5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prr16A3KMN5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prr16A3KMN5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prr16A3KMN5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prr16A3KMN5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prr16A3KMN5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prr16A3KMN5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prr16A3KMN5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prr16A3KMN5 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prr16A3KMN5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Prr16A3KMN5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Prr16A3KMN5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prr16A3KMN5 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prr16A3KMN5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prr16A3KMN5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prr16A3KMN5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prr16A3KMN5 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prr16A3KMN5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prr16A3KMN5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prr16A3KMN5 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prr16A3KMN5 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prr16A3KMN5 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prr16A3KMN5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prr16A3KMN5 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Prr16A3KMN5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prr16A3KMN5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prr16A3KMN5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prr16A3KMN5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Prr16A3KMN5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prr16A3KMN5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Prr16A3KMN5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prr16A3KMN5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prr16A3KMN5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Prr16A3KMN5 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Prr16A3KMN5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Prr16A3KMN5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Prr16A3KMN5 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Prr16A3KMN5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Prr16A3KMN5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prr16A3KMN5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prr16A3KMN5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prr16A3KMN5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prr16A3KMN5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prr16A3KMN5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prr16A3KMN5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prr16A3KMN5 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prr16A3KMN5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prr16A3KMN5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prr16A3KMN5 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prr16A3KMN5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Prr16A3KMN5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Prr16A3KMN5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prr16A3KMN5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prr16A3KMN5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prr16A3KMN5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prr16A3KMN5 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prr16A3KMN5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Prr16A3KMN5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Prr16A3KMN5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prr16A3KMN5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Prr16A3KMN5 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Prr16A3KMN5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Prr16A3KMN5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Prr16A3KMN5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prr16A3KMN5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prr16A3KMN5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prr16A3KMN5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Prr16A3KMN5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prr16A3KMN5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prr16A3KMN5 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prr16A3KMN5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prr16A3KMN5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prr16A3KMN5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prr16A3KMN5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prr16A3KMN5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prr16A3KMN5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prr16A3KMN5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prr16A3KMN5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Prr16A3KMN5 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Prr16A3KMN5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prr16A3KMN5 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prr16A3KMN5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prr16A3KMN5 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms